MiniMUGA Sample Report - Initial Version |
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Sample ID | C57BL/6J-Tg(GFAP-CHRM3*)6Kdmc/Mmnc_M_32200 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Neogen ID | DB0038 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Strain ID | 42286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Strain Name | C57BL/6J-Tg(GFAP-CHRM3*)6Kdmc/Mmnc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The genotype of this sample is of excellent quality.
It is male and inbred,
and likely a C57BL/6J mouse.
Diagnostic SNPs indicate the presence of the background strain groups C57BL/6 and the substrains C57BL/6J. No genetic constructs were detected in this sample. |
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Genotyping Quality |
Excellent (4 N calls)
All reported results are dependent on genotyping quality. |
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Chromosomal Sex | XY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inbreeding Estimate | Inbred (6 H calls at autosomal, X, and PAR chromosome markers) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inbreeding and Genotyping Quality (Plot) |
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Constructs Detected |
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Primary Background
(Autosomes, X Chromosome) |
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Secondary Background
(Autosomes, X Chromosome) |
Not Applicable | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Y Chromosome |
Y Haplogroup 14 - 100.0% Consistent
Includes C57BL/6J and 10 other strains |
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MT Chromosome |
MT Haplogroup 1 - 100.0% Consistent
Includes C57BL/6J and 161 other strains |
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Background Ideogram | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Backgrounds Detected
(Diagnostic Alleles) |
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Refined Analysis |
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Refined Ideogram | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Notes | The report agrees with strain nomenclature and the SDS. |