MiniMUGA Sample Report - Refined Analysis |
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Sample ID | MMRRC_UNC_M40219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Neogen ID | FZ8322 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Strain ID | 43918 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Strain Name | 129S6;129P2-Grin1tm1Bhk/Mmnc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The genotype of this sample is of excellent quality.
It is male and inbred,
and likely a mix of 129S6/SvEvTac and 129P2/OlaHsd.
Diagnostic SNPs indicate the presence of the background strain groups 129S. No genetic constructs were detected in this sample. |
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Genotyping Quality |
Excellent (6 N calls)
All reported results are dependent on genotyping quality. |
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Chromosomal Sex | XY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inbreeding Estimate | Inbred (1 H calls at autosomal, X, and PAR chromosome markers) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inbreeding and Genotyping Quality (Plot) |
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Constructs Detected |
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Primary Background
(Autosomes, X Chromosome) |
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Secondary Background
(Autosomes, X Chromosome) |
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Y Chromosome |
Y Haplogroup 6 - 98.4% Consistent
Includes 129P2/OlaHsd, 129S6/SvEvTac and 10 other strains |
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MT Chromosome |
MT Haplogroup 6 - 100.0% Consistent
Includes 129S6/SvEvTac and 12 other strains |
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Background Ideogram | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Backgrounds Detected
(Diagnostic Alleles) |
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Refined Analysis |
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Refined Ideogram | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Notes | The report agrees with strain nomenclature and the SDS. |