MiniMUGA Sample Report - Refined Analysis |
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Sample ID | MMRRC_B6;129S7-Amhr2tm3(cre)Bhr/Mmnc_F31174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Neogen ID | HT0195 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Strain ID | 14245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Strain Name | B6;129S7-Amhr2tm3(cre)Bhr/Mmnc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The genotype of this sample is of excellent quality.
It is female and inbred,
and likely a C57BL/6J mouse.
Diagnostic SNPs indicate the presence of the background strain groups C57BL/6 and the substrains C57BL/6J. The sample contains the following genetic constructs: Cre recombinase, Internal Ribosome Entry Site |
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Genotyping Quality |
Excellent (7 N calls)
All reported results are dependent on genotyping quality. |
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Chromosomal Sex | XX | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inbreeding Estimate | Inbred (6 H calls at autosomal, X, and PAR chromosome markers) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inbreeding and Genotyping Quality (Plot) |
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Constructs Detected |
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Primary Background
(Autosomes, X Chromosome) |
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Secondary Background
(Autosomes, X Chromosome) |
Not Applicable | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MT Chromosome |
MT Haplogroup 1 - 100.0% Consistent
Includes C57BL/6J and 161 other strains |
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Background Ideogram | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Backgrounds Detected
(Diagnostic Alleles) |
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Refined Analysis |
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Refined Ideogram | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Notes | The report is consistent with with strain nomenclature and the SDS. The mouse is congenic for C57BL/6J at MiniMUGA resolution level. The presence of Cre and IRES constructs are detected. |