MiniMUGA Sample Report - V2 |
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Sample ID | MMRRC_B6;129S4-Myh9tm3(GFP/MYH9/MYH10)Rsad/Mmnc_M30970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Neogen ID | VM4183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Strain ID | 34322 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Strain Name | B6;129S4-Myh9tm3(GFP/MYH9/MYH10)Rsad/Mmnc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The genotype of this sample is of excellent quality.
It is male and inbred,
and likely a mix of multiple C57BL/6 substrains and 129S4/SvJaeJ.
Diagnostic SNPs indicate the presence of the background strain groups C57BL/6 and the substrains C57BL/6J. The sample contains the following genetic constructs: Bovine growth hormone poly A signal sequence, "Greenish" Fluorescent Protein (EGFP, EYFP, ECFP) |
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Genotyping Quality |
Excellent (3 N calls)
All reported results are dependent on genotyping quality. |
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Chromosomal Sex | XY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inbreeding Estimate | Inbred (44 H calls at autosomal, X, and PAR chromosome markers) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inbreeding and Genotyping Quality (Plot) |
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Constructs Detected |
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Primary Background
(Autosomes, X Chromosome) |
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Secondary Background
(Autosomes, X Chromosome) |
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Y Chromosome |
Y Haplogroup 14 - 100.0% Consistent
Includes C57BL/6J and 10 other strains |
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MT Chromosome |
MT Haplogroup 1 - 100.0% Consistent
Includes B6N-Tyr |
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Background Ideogram | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Backgrounds Detected
(Diagnostic Alleles) |
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Refined Analysis |
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Refined Ideogram | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Notes | The report is consistent with strain nomenclature and SDS. The presence of GFP and bpA constructs are detected. |