MiniMUGA Sample Report - V2 |
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Sample ID | MMRRC_UNC_M37518 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Neogen ID | WD9180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Strain ID | 42291 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Strain Name | B6;129-Btbd18tm1Dean/Mmnc | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The genotype of this sample is of excellent quality.
It is male and outbred,
and likely a mix of multiple C57BL/6 substrains and 129S4/SvJaeJ.
Diagnostic SNPs indicate the presence of the background strain groups 129S, C57BL/6 and the substrains B6N-Tyr The sample contains the following genetic constructs: Bovine growth hormone poly A signal sequence |
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Genotyping Quality |
Excellent (6 N calls)
All reported results are dependent on genotyping quality. |
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Chromosomal Sex | XY | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inbreeding Estimate | Outbred (406 H calls at autosomal, X, and PAR chromosome markers) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inbreeding and Genotyping Quality (Plot) |
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Constructs Detected |
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Primary Background
(Autosomes, X Chromosome) |
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Secondary Background
(Autosomes, X Chromosome) |
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Y Chromosome |
Y Haplogroup 6 - 98.4% Consistent
Includes 129S4/SvJaeJ and 11 other strains |
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MT Chromosome |
MT Haplogroup 1 - 100.0% Consistent
Includes B6N-Tyr |
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Background Ideogram | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Backgrounds Detected
(Diagnostic Alleles) |
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Refined Analysis |
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Refined Ideogram | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Notes | The sample is outbred. Strain diagnostics are consistent with strain description. The presence of the BpA construct is detected. The Y chromosome is from 129S. |